Prevalence of IL-1A and IL-1B polymorphisms in a Greek population
Abstract
enObjectives: Given the possible ethnic diversity in distribution of genetic variants, aim of the present study was to estimate the prevalence of the polymorphisms of IL-1A+4845 and IL-1B+3954 in a Greek population of unknown periodontal status and to compare this prevalence with one from a group of patients with chronic (adult) periodontitis.
Material and methods: 110 healthy subjects of unknown periodontal status and 45 patients with chronic periodontitis were genotyped, using a PCR-based method and primers described in the literature. The differences in genotype, allele frequencies, allele carriage rate and presence of positive composite genotype as described by Kornman et al. (1997) were analyzed using Fisher's exact test and calculating two-sided p-value, odds ratios and confidence intervals.
Results: No differences were observed in any of the parameters tested between the two groups.
Conclusions: Given the high prevalences of these polymorphisms observed in the general population,findings of the present study do not support a possible predictive value of the presence of allele 2 at IL-1A+4845 and IL-1B+3954 or the positive composite genotype for presence or absence of periodontal disease,in a Greek population.
Zusammenfassung
dePrävalenz von IL-1A und IL-1B Polymorpismen in einer griechischen Bevölkerung.
Zielsetzung: Aufgrund der möglichen ethnischen Diversierung bezüglich der Verteilung genetischer Varianten, Ziel der vorliegenden Studie war die Untersuchung der Prävalenz von IL-1A und IL-1B Polymorphismen bei einer griechischen Bevölkerung von nicht bekannten Parodontalstatus. Gleichzeitig wurde diese Prävalenz mit der entsprechenden einer Patientengruppe mit chronischen Erwachsenenparodontitis verglichen.
Material und Methodik: 110 gesunde Teilnehmer mit nicht bekanntem Paradontalstatus und 45 Patienten mit chronischer Erwachsenenparodontitis wurden in die Studie aufgenommen. Eine PCR-basierte Methode, sowie die Primers-Technik die in der Literatur beschrieben wird, wurden für die Genotypierung der Patienten benutzt. Die Unterschiede im Bezug auf Genotyp, Allelen Frequenz, Allelen Träger-Rate und Auftreten von positiven Komposit-Genotyps, wie sie von Kornman et al (1977) beschrieben wurde, wurden ausgewertet. Zur statischen Analyse wurde der Test nach Fischer herangezogen.
Ergebnisse: Es wurden keine Unterschiede bei aden untersuchten Parametern zweischen der zwei Probantengruppen beoabachtet.
Schlussfolgerungen: Die Befunde der vorliegenden Studie zeigten keinen voraussagbaren Wert bezüglich der Anwesenheit von Allele 2 der IL-1A und IL-1B oder des positiven Komposit-Genotyps, die mit der Existenz von Paradontalerkrankungen bei einer griechischen Bevöolkerung assoziiert werden.
Résumé
frPrévalence des polymorphismes IL-1a et IL-1b au sein d’une population grecque.
Objectifs: Etant donné la diversité ethnique possible dans la distribution des variantes génétiques, le but de la présente étude est d’estimer la prévalence des polymorphismes de IL-1a+4845 et IL-1b+3954 au sein d’une population grecque à l’état parodontal inconnu et de comparer cette prévalence avec celle d’un groupe de patients souffrant de la parodontite chronique de l’adulte.
Matériaux et méthodes: le génotype de 110 sujets sains à l’état parodontal inconnu et de 45 patients souffrant de parodontite chronique a étéétabli à l’aide d’une méthode PCR (amplification en chaîne par la polymérase) et d’amorces décrites dans la documentation. Les différences de génotype, de fréquences alléliques, de taux de transmission allélique et la présence d’un génotype composite positif tel qu’il a été décrit par Kornman et al (1997) ont été analysées en utilisant le test exact de Fisher et en calculant la valeur p bilatérale, les rapports des cotes et les intervalles de confiance.
Résultats: Aucune différence n’a été observée parmi les paramètres testés entre les deux groupes.
Conclusions: Etant donné les fortes prévalences de ces polymorphismes au sein de la population générale, les conclusions de la présente étude ne confirment pas un coefficient de prévision possible de la présence de l’allèle de type 2 sur IL-1a+4845 et IL-1b+3954 ou le génotype composite positif pour la présence ou l’absence de maladie parodontale au sein d’une population grecque.
